Yayasan Sanggar Inovasi Desa (YSID) terbentuk atas inisiasi Pemerintah Desa Panggungharjo bersama para pegiat pembangunan desa di Yogyakarta, dalam upaya membangun arena inovasi dan perbaikan tata kelola pemerintahan desa, serta pengembangan kewirausahaan di desa.  YSID hadir sebagai wahana pembentukan ekosistem inovasi kemandirian desa melalui pendokumentasian pengalaman hingga desain knowledge management sektor desa yang bertumpu pada nilai otentik, lestari dan tumbuh bersama dengan mengarusutamakan kerja-kerja kolaboratif lintas stakeholder. 

YSID diresmikan oleh Menteri Desa PDTT, pada 5 Januari 2020 di Yogyakarta. Pendirian YSID disahkan melalui Keputusan Menteri Hukum dan Hak Asasi Manusia, Nomor AHU-0010592.AH.01.04. Tahun 2020.

Program – program yang dijalankan YSID mencakup namun tidak terbatas pada Riset, Pelatihan, Pendampingan, dan Pengembangan Sistem. YSID telah menjalin kerjasama dan kolaborasi dengan berbagai pihak, mulai dari sektor pemerintah, swasta, komunitas, dan universitas